data_MD_SNFG
#
_pdbx_database_status.entry_id MD_SNFG
_pdbx_database_status.status_code .
_pdbx_database_status.status_code_sf ?
_pdbx_database_status.status_code_mr ?
_pdbx_database_status.status_code_cs ?
_pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date ?
_pdbx_database_status.status_code_nmr_data ?
_pdbx_database_status.deposit_site ?
_pdbx_database_status.process_site ?
_pdbx_database_status.SG_entry ?
_pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y
_pdbx_database_status.methods_development_category ?
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.pdbx_ec
_entity.pdbx_mutation
_entity.pdbx_fragment
_entity.details
1 branched man "alpha-D-glucopyranose-(1-2)-alpha-D-glucopyranose-(1-6)-alpha-D-glucopyranose" 504.438 1 ? ? ? ?
2 non-polymer syn ? ? 1 ? ? ? ?
3 non-polymer syn "ALPHA-CYCLODEXTRIN (CYCLOHEXA-AMYLOSE)" 972.844 10 ? ? ? ?
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 ROH 1 1 1 ROH ROH ? .
C 3 ACX 1 3 3 ACX ACX ? .
D 3 ACX 1 4 4 ACX ACX ? .
E 3 ACX 1 5 5 ACX ACX ? .
F 3 ACX 1 8 8 ACX ACX ? .
G 3 ACX 1 9 9 ACX ACX ? .
H 3 ACX 1 10 10 ACX ACX ? .
I 3 ACX 1 11 11 ACX ACX ? .
J 3 ACX 1 12 12 ACX ACX ? .
K 3 ACX 1 13 13 ACX ACX ? .
L 3 ACX 1 14 14 ACX ACX ? .
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.mon_nstd_flag
_chem_comp.name
_chem_comp.pdbx_synonyms
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
ACX saccharide . "ALPHA-CYCLODEXTRIN (CYCLOHEXA-AMYLOSE)" ? "C36 H60 O30" 972.844
GLC "D-saccharide, alpha linking" . alpha-D-glucopyranose "alpha-D-glucose; D-glucose; glucose" "C6 H12 O6" 180.156
ROH non-polymer . "UNKNOWN LIGAND" ? ? ?
#
loop_
_struct_conn.id
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.details
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
_struct_conn.pdbx_role
covale1 covale both ? A GLC . O6 ? ? ? 1_555 A GLC . C1 ? ? ? GLC 1 ? GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.501 sing ?
covale2 covale both ? A GLC . O2 ? ? ? 1_555 A GLC . C1 ? ? ? GLC 2 ? GLC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.420 sing ?
#
loop_
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.details
A N N 1 ?
B N N 2 ?
C N N 3 ?
D N N 3 ?
E N N 3 ?
F N N 3 ?
G N N 3 ?
H N N 3 ?
I N N 3 ?
J N N 3 ?
K N N 3 ?
L N N 3 ?
#
_atom_sites.entry_id MD_SNFG
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000
_atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000
_atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000
_atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000
#
loop_
_pdbx_validate_close_contact.id
_pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num
_pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1
_pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1
_pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1
_pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1
_pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1
_pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1
_pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2
_pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2
_pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2
_pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2
_pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2
_pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2
_pdbx_validate_close_contact.dist
1 1 O4 . GLC 2 ? ? C1A . ACX 13 ? ? 1.28
2 1 O4 . GLC 3 ? ? C1A . ACX 10 ? ? 1.29
3 1 O2 . GLC 1 ? ? C1A . ACX 3 ? ? 1.30
4 1 O3 . GLC 3 ? ? C1A . ACX 9 ? ? 1.31
5 1 O3 . GLC 1 ? ? C1A . ACX 4 ? ? 1.33
6 1 O6 . GLC 3 ? ? C1A . ACX 11 ? ? 1.33
7 1 O4 . GLC 1 ? ? C1A . ACX 5 ? ? 1.33
8 1 O3 . GLC 2 ? ? C1A . ACX 12 ? ? 1.34
9 1 O6 . GLC 2 ? ? C1A . ACX 14 ? ? 1.34
10 1 O2 . GLC 3 ? ? C1A . ACX 8 ? ? 1.37
11 1 O1 . ROH 1 ? ? C1 . GLC 1 ? ? 1.42
#
loop_
_pdbx_validate_chiral.id
_pdbx_validate_chiral.PDB_model_num
_pdbx_validate_chiral.auth_atom_id
_pdbx_validate_chiral.label_alt_id
_pdbx_validate_chiral.auth_asym_id
_pdbx_validate_chiral.auth_comp_id
_pdbx_validate_chiral.auth_seq_id
_pdbx_validate_chiral.PDB_ins_code
_pdbx_validate_chiral.details
_pdbx_validate_chiral.omega
1 1 C1 ? . GLC 2 ? "WRONG HAND" .
2 1 C1 ? . GLC 3 ? "WRONG HAND" .
#
loop_
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id
_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id
1 1 N 1 . GLC 1 ? O1 ? A GLC 1 O1
2 1 N 1 . ACX 3 ? C1F ? C ACX 1 C1F
3 1 N 1 . ACX 3 ? C2F ? C ACX 1 C2F
4 1 N 1 . ACX 3 ? C3F ? C ACX 1 C3F
5 1 N 1 . ACX 3 ? C4F ? C ACX 1 C4F
6 1 N 1 . ACX 3 ? C5F ? C ACX 1 C5F
7 1 N 1 . ACX 3 ? C6F ? C ACX 1 C6F
8 1 N 1 . ACX 3 ? O2F ? C ACX 1 O2F
9 1 N 1 . ACX 3 ? O3F ? C ACX 1 O3F
10 1 N 1 . ACX 3 ? O1E ? C ACX 1 O1E
11 1 N 1 . ACX 3 ? O5F ? C ACX 1 O5F
12 1 N 1 . ACX 3 ? O6F ? C ACX 1 O6F
13 1 N 1 . ACX 3 ? C1E ? C ACX 1 C1E
14 1 N 1 . ACX 3 ? C2E ? C ACX 1 C2E
15 1 N 1 . ACX 3 ? C3E ? C ACX 1 C3E
16 1 N 1 . ACX 3 ? C4E ? C ACX 1 C4E
17 1 N 1 . ACX 3 ? C5E ? C ACX 1 C5E
18 1 N 1 . ACX 3 ? C6E ? C ACX 1 C6E
19 1 N 1 . ACX 3 ? O2E ? C ACX 1 O2E
20 1 N 1 . ACX 3 ? O3E ? C ACX 1 O3E
21 1 N 1 . ACX 3 ? O1D ? C ACX 1 O1D
22 1 N 1 . ACX 3 ? O5E ? C ACX 1 O5E
23 1 N 1 . ACX 3 ? O6E ? C ACX 1 O6E
24 1 N 1 . ACX 3 ? C1D ? C ACX 1 C1D
25 1 N 1 . ACX 3 ? C2D ? C ACX 1 C2D
26 1 N 1 . ACX 3 ? C3D ? C ACX 1 C3D
27 1 N 1 . ACX 3 ? C4D ? C ACX 1 C4D
28 1 N 1 . ACX 3 ? C5D ? C ACX 1 C5D
29 1 N 1 . ACX 3 ? C6D ? C ACX 1 C6D
30 1 N 1 . ACX 3 ? O2D ? C ACX 1 O2D
31 1 N 1 . ACX 3 ? O3D ? C ACX 1 O3D
32 1 N 1 . ACX 3 ? O1C ? C ACX 1 O1C
33 1 N 1 . ACX 3 ? O5D ? C ACX 1 O5D
34 1 N 1 . ACX 3 ? O6D ? C ACX 1 O6D
35 1 N 1 . ACX 3 ? C1C ? C ACX 1 C1C
36 1 N 1 . ACX 3 ? C2C ? C ACX 1 C2C
37 1 N 1 . ACX 3 ? C3C ? C ACX 1 C3C
38 1 N 1 . ACX 3 ? C4C ? C ACX 1 C4C
39 1 N 1 . ACX 3 ? C5C ? C ACX 1 C5C
40 1 N 1 . ACX 3 ? C6C ? C ACX 1 C6C
41 1 N 1 . ACX 3 ? O2C ? C ACX 1 O2C
42 1 N 1 . ACX 3 ? O3C ? C ACX 1 O3C
43 1 N 1 . ACX 3 ? O1B ? C ACX 1 O1B
44 1 N 1 . ACX 3 ? O5C ? C ACX 1 O5C
45 1 N 1 . ACX 3 ? O6C ? C ACX 1 O6C
46 1 N 1 . ACX 3 ? C1B ? C ACX 1 C1B
47 1 N 1 . ACX 3 ? C2B ? C ACX 1 C2B
48 1 N 1 . ACX 3 ? C3B ? C ACX 1 C3B
49 1 N 1 . ACX 3 ? C4B ? C ACX 1 C4B
50 1 N 1 . ACX 3 ? C5B ? C ACX 1 C5B
51 1 N 1 . ACX 3 ? C6B ? C ACX 1 C6B
52 1 N 1 . ACX 3 ? O2B ? C ACX 1 O2B
53 1 N 1 . ACX 3 ? O3B ? C ACX 1 O3B
54 1 N 1 . ACX 3 ? O5B ? C ACX 1 O5B
55 1 N 1 . ACX 3 ? O6B ? C ACX 1 O6B
56 1 N 1 . ACX 3 ? C3A ? C ACX 1 C3A
57 1 N 1 . ACX 3 ? C4A ? C ACX 1 C4A
58 1 N 1 . ACX 3 ? C5A ? C ACX 1 C5A
59 1 N 1 . ACX 3 ? C6A ? C ACX 1 C6A
60 1 N 1 . ACX 3 ? O2A ? C ACX 1 O2A
61 1 N 1 . ACX 3 ? O3A ? C ACX 1 O3A
62 1 N 1 . ACX 3 ? O1F ? C ACX 1 O1F
63 1 N 1 . ACX 3 ? O5A ? C ACX 1 O5A
64 1 N 1 . ACX 3 ? O6A ? C ACX 1 O6A
65 1 N 1 . ACX 4 ? C1F ? D ACX 1 C1F
66 1 N 1 . ACX 4 ? C2F ? D ACX 1 C2F
67 1 N 1 . ACX 4 ? C3F ? D ACX 1 C3F
68 1 N 1 . ACX 4 ? C4F ? D ACX 1 C4F
69 1 N 1 . ACX 4 ? C5F ? D ACX 1 C5F
70 1 N 1 . ACX 4 ? C6F ? D ACX 1 C6F
71 1 N 1 . ACX 4 ? O2F ? D ACX 1 O2F
72 1 N 1 . ACX 4 ? O3F ? D ACX 1 O3F
73 1 N 1 . ACX 4 ? O1E ? D ACX 1 O1E
74 1 N 1 . ACX 4 ? O5F ? D ACX 1 O5F
75 1 N 1 . ACX 4 ? O6F ? D ACX 1 O6F
76 1 N 1 . ACX 4 ? C1E ? D ACX 1 C1E
77 1 N 1 . ACX 4 ? C2E ? D ACX 1 C2E
78 1 N 1 . ACX 4 ? C3E ? D ACX 1 C3E
79 1 N 1 . ACX 4 ? C4E ? D ACX 1 C4E
80 1 N 1 . ACX 4 ? C5E ? D ACX 1 C5E
81 1 N 1 . ACX 4 ? C6E ? D ACX 1 C6E
82 1 N 1 . ACX 4 ? O2E ? D ACX 1 O2E
83 1 N 1 . ACX 4 ? O3E ? D ACX 1 O3E
84 1 N 1 . ACX 4 ? O1D ? D ACX 1 O1D
85 1 N 1 . ACX 4 ? O5E ? D ACX 1 O5E
86 1 N 1 . ACX 4 ? O6E ? D ACX 1 O6E
87 1 N 1 . ACX 4 ? C1D ? D ACX 1 C1D
88 1 N 1 . ACX 4 ? C2D ? D ACX 1 C2D
89 1 N 1 . ACX 4 ? C3D ? D ACX 1 C3D
90 1 N 1 . ACX 4 ? C4D ? D ACX 1 C4D
91 1 N 1 . ACX 4 ? C5D ? D ACX 1 C5D
92 1 N 1 . ACX 4 ? C6D ? D ACX 1 C6D
93 1 N 1 . ACX 4 ? O2D ? D ACX 1 O2D
94 1 N 1 . ACX 4 ? O3D ? D ACX 1 O3D
95 1 N 1 . ACX 4 ? O1C ? D ACX 1 O1C
96 1 N 1 . ACX 4 ? O5D ? D ACX 1 O5D
97 1 N 1 . ACX 4 ? O6D ? D ACX 1 O6D
98 1 N 1 . ACX 4 ? C1C ? D ACX 1 C1C
99 1 N 1 . ACX 4 ? C2C ? D ACX 1 C2C
100 1 N 1 . ACX 4 ? C3C ? D ACX 1 C3C
101 1 N 1 . ACX 4 ? C4C ? D ACX 1 C4C
102 1 N 1 . ACX 4 ? C5C ? D ACX 1 C5C
103 1 N 1 . ACX 4 ? C6C ? D ACX 1 C6C
104 1 N 1 . ACX 4 ? O2C ? D ACX 1 O2C
105 1 N 1 . ACX 4 ? O3C ? D ACX 1 O3C
106 1 N 1 . ACX 4 ? O1B ? D ACX 1 O1B
107 1 N 1 . ACX 4 ? O5C ? D ACX 1 O5C
108 1 N 1 . ACX 4 ? O6C ? D ACX 1 O6C
109 1 N 1 . ACX 4 ? C1B ? D ACX 1 C1B
110 1 N 1 . ACX 4 ? C2B ? D ACX 1 C2B
111 1 N 1 . ACX 4 ? C3B ? D ACX 1 C3B
112 1 N 1 . ACX 4 ? C4B ? D ACX 1 C4B
113 1 N 1 . ACX 4 ? C5B ? D ACX 1 C5B
114 1 N 1 . ACX 4 ? C6B ? D ACX 1 C6B
115 1 N 1 . ACX 4 ? O2B ? D ACX 1 O2B
116 1 N 1 . ACX 4 ? O3B ? D ACX 1 O3B
117 1 N 1 . ACX 4 ? O5B ? D ACX 1 O5B
118 1 N 1 . ACX 4 ? O6B ? D ACX 1 O6B
119 1 N 1 . ACX 4 ? C3A ? D ACX 1 C3A
120 1 N 1 . ACX 4 ? C4A ? D ACX 1 C4A
121 1 N 1 . ACX 4 ? C5A ? D ACX 1 C5A
122 1 N 1 . ACX 4 ? C6A ? D ACX 1 C6A
123 1 N 1 . ACX 4 ? O2A ? D ACX 1 O2A
124 1 N 1 . ACX 4 ? O3A ? D ACX 1 O3A
125 1 N 1 . ACX 4 ? O1F ? D ACX 1 O1F
126 1 N 1 . ACX 4 ? O5A ? D ACX 1 O5A
127 1 N 1 . ACX 4 ? O6A ? D ACX 1 O6A
128 1 N 1 . ACX 5 ? C1F ? E ACX 1 C1F
129 1 N 1 . ACX 5 ? C2F ? E ACX 1 C2F
130 1 N 1 . ACX 5 ? C3F ? E ACX 1 C3F
131 1 N 1 . ACX 5 ? C4F ? E ACX 1 C4F
132 1 N 1 . ACX 5 ? C5F ? E ACX 1 C5F
133 1 N 1 . ACX 5 ? C6F ? E ACX 1 C6F
134 1 N 1 . ACX 5 ? O2F ? E ACX 1 O2F
135 1 N 1 . ACX 5 ? O3F ? E ACX 1 O3F
136 1 N 1 . ACX 5 ? O1E ? E ACX 1 O1E
137 1 N 1 . ACX 5 ? O5F ? E ACX 1 O5F
138 1 N 1 . ACX 5 ? O6F ? E ACX 1 O6F
139 1 N 1 . ACX 5 ? C1E ? E ACX 1 C1E
140 1 N 1 . ACX 5 ? C2E ? E ACX 1 C2E
141 1 N 1 . ACX 5 ? C3E ? E ACX 1 C3E
142 1 N 1 . ACX 5 ? C4E ? E ACX 1 C4E
143 1 N 1 . ACX 5 ? C5E ? E ACX 1 C5E
144 1 N 1 . ACX 5 ? C6E ? E ACX 1 C6E
145 1 N 1 . ACX 5 ? O2E ? E ACX 1 O2E
146 1 N 1 . ACX 5 ? O3E ? E ACX 1 O3E
147 1 N 1 . ACX 5 ? O1D ? E ACX 1 O1D
148 1 N 1 . ACX 5 ? O5E ? E ACX 1 O5E
149 1 N 1 . ACX 5 ? O6E ? E ACX 1 O6E
150 1 N 1 . ACX 5 ? C1D ? E ACX 1 C1D
151 1 N 1 . ACX 5 ? C2D ? E ACX 1 C2D
152 1 N 1 . ACX 5 ? C3D ? E ACX 1 C3D
153 1 N 1 . ACX 5 ? C4D ? E ACX 1 C4D
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159 1 N 1 . ACX 5 ? O5D ? E ACX 1 O5D
160 1 N 1 . ACX 5 ? O6D ? E ACX 1 O6D
161 1 N 1 . ACX 5 ? C1C ? E ACX 1 C1C
162 1 N 1 . ACX 5 ? C2C ? E ACX 1 C2C
163 1 N 1 . ACX 5 ? C3C ? E ACX 1 C3C
164 1 N 1 . ACX 5 ? C4C ? E ACX 1 C4C
165 1 N 1 . ACX 5 ? C5C ? E ACX 1 C5C
166 1 N 1 . ACX 5 ? C6C ? E ACX 1 C6C
167 1 N 1 . ACX 5 ? O2C ? E ACX 1 O2C
168 1 N 1 . ACX 5 ? O3C ? E ACX 1 O3C
169 1 N 1 . ACX 5 ? O1B ? E ACX 1 O1B
170 1 N 1 . ACX 5 ? O5C ? E ACX 1 O5C
171 1 N 1 . ACX 5 ? O6C ? E ACX 1 O6C
172 1 N 1 . ACX 5 ? C1B ? E ACX 1 C1B
173 1 N 1 . ACX 5 ? C2B ? E ACX 1 C2B
174 1 N 1 . ACX 5 ? C3B ? E ACX 1 C3B
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359 1 N 1 . ACX 10 ? O5C ? H ACX 1 O5C
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361 1 N 1 . ACX 10 ? C1B ? H ACX 1 C1B
362 1 N 1 . ACX 10 ? C2B ? H ACX 1 C2B
363 1 N 1 . ACX 10 ? C3B ? H ACX 1 C3B
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366 1 N 1 . ACX 10 ? C6B ? H ACX 1 C6B
367 1 N 1 . ACX 10 ? O2B ? H ACX 1 O2B
368 1 N 1 . ACX 10 ? O3B ? H ACX 1 O3B
369 1 N 1 . ACX 10 ? O5B ? H ACX 1 O5B
370 1 N 1 . ACX 10 ? O6B ? H ACX 1 O6B
371 1 N 1 . ACX 10 ? C3A ? H ACX 1 C3A
372 1 N 1 . ACX 10 ? C4A ? H ACX 1 C4A
373 1 N 1 . ACX 10 ? C5A ? H ACX 1 C5A
374 1 N 1 . ACX 10 ? C6A ? H ACX 1 C6A
375 1 N 1 . ACX 10 ? O2A ? H ACX 1 O2A
376 1 N 1 . ACX 10 ? O3A ? H ACX 1 O3A
377 1 N 1 . ACX 10 ? O1F ? H ACX 1 O1F
378 1 N 1 . ACX 10 ? O5A ? H ACX 1 O5A
379 1 N 1 . ACX 10 ? O6A ? H ACX 1 O6A
380 1 N 1 . ACX 11 ? C1F ? I ACX 1 C1F
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397 1 N 1 . ACX 11 ? O2E ? I ACX 1 O2E
398 1 N 1 . ACX 11 ? O3E ? I ACX 1 O3E
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402 1 N 1 . ACX 11 ? C1D ? I ACX 1 C1D
403 1 N 1 . ACX 11 ? C2D ? I ACX 1 C2D
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450 1 N 1 . ACX 12 ? O3F ? J ACX 1 O3F
451 1 N 1 . ACX 12 ? O1E ? J ACX 1 O1E
452 1 N 1 . ACX 12 ? O5F ? J ACX 1 O5F
453 1 N 1 . ACX 12 ? O6F ? J ACX 1 O6F
454 1 N 1 . ACX 12 ? C1E ? J ACX 1 C1E
455 1 N 1 . ACX 12 ? C2E ? J ACX 1 C2E
456 1 N 1 . ACX 12 ? C3E ? J ACX 1 C3E
457 1 N 1 . ACX 12 ? C4E ? J ACX 1 C4E
458 1 N 1 . ACX 12 ? C5E ? J ACX 1 C5E
459 1 N 1 . ACX 12 ? C6E ? J ACX 1 C6E
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467 1 N 1 . ACX 12 ? C3D ? J ACX 1 C3D
468 1 N 1 . ACX 12 ? C4D ? J ACX 1 C4D
469 1 N 1 . ACX 12 ? C5D ? J ACX 1 C5D
470 1 N 1 . ACX 12 ? C6D ? J ACX 1 C6D
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485 1 N 1 . ACX 12 ? O5C ? J ACX 1 O5C
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487 1 N 1 . ACX 12 ? C1B ? J ACX 1 C1B
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491 1 N 1 . ACX 12 ? C5B ? J ACX 1 C5B
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493 1 N 1 . ACX 12 ? O2B ? J ACX 1 O2B
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495 1 N 1 . ACX 12 ? O5B ? J ACX 1 O5B
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497 1 N 1 . ACX 12 ? C3A ? J ACX 1 C3A
498 1 N 1 . ACX 12 ? C4A ? J ACX 1 C4A
499 1 N 1 . ACX 12 ? C5A ? J ACX 1 C5A
500 1 N 1 . ACX 12 ? C6A ? J ACX 1 C6A
501 1 N 1 . ACX 12 ? O2A ? J ACX 1 O2A
502 1 N 1 . ACX 12 ? O3A ? J ACX 1 O3A
503 1 N 1 . ACX 12 ? O1F ? J ACX 1 O1F
504 1 N 1 . ACX 12 ? O5A ? J ACX 1 O5A
505 1 N 1 . ACX 12 ? O6A ? J ACX 1 O6A
506 1 N 1 . ACX 13 ? C1F ? K ACX 1 C1F
507 1 N 1 . ACX 13 ? C2F ? K ACX 1 C2F
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511 1 N 1 . ACX 13 ? C6F ? K ACX 1 C6F
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517 1 N 1 . ACX 13 ? C1E ? K ACX 1 C1E
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550 1 N 1 . ACX 13 ? C1B ? K ACX 1 C1B
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554 1 N 1 . ACX 13 ? C5B ? K ACX 1 C5B
555 1 N 1 . ACX 13 ? C6B ? K ACX 1 C6B
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557 1 N 1 . ACX 13 ? O3B ? K ACX 1 O3B
558 1 N 1 . ACX 13 ? O5B ? K ACX 1 O5B
559 1 N 1 . ACX 13 ? O6B ? K ACX 1 O6B
560 1 N 1 . ACX 13 ? C3A ? K ACX 1 C3A
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562 1 N 1 . ACX 13 ? C5A ? K ACX 1 C5A
563 1 N 1 . ACX 13 ? C6A ? K ACX 1 C6A
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573 1 N 1 . ACX 14 ? C5F ? L ACX 1 C5F
574 1 N 1 . ACX 14 ? C6F ? L ACX 1 C6F
575 1 N 1 . ACX 14 ? O2F ? L ACX 1 O2F
576 1 N 1 . ACX 14 ? O3F ? L ACX 1 O3F
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578 1 N 1 . ACX 14 ? O5F ? L ACX 1 O5F
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584 1 N 1 . ACX 14 ? C5E ? L ACX 1 C5E
585 1 N 1 . ACX 14 ? C6E ? L ACX 1 C6E
586 1 N 1 . ACX 14 ? O2E ? L ACX 1 O2E
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588 1 N 1 . ACX 14 ? O1D ? L ACX 1 O1D
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610 1 N 1 . ACX 14 ? O1B ? L ACX 1 O1B
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627 1 N 1 . ACX 14 ? O2A ? L ACX 1 O2A
628 1 N 1 . ACX 14 ? O3A ? L ACX 1 O3A
629 1 N 1 . ACX 14 ? O1F ? L ACX 1 O1F
630 1 N 1 . ACX 14 ? O5A ? L ACX 1 O5A
631 1 N 1 . ACX 14 ? O6A ? L ACX 1 O6A
#
loop_
_atom_type.symbol
C
H
O
#
_entry.id MD_SNFG
#
loop_
_pdbx_branch_scheme.asym_id
_pdbx_branch_scheme.entity_id
_pdbx_branch_scheme.mon_id
_pdbx_branch_scheme.num
_pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id
_pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_branch_scheme.auth_asym_id
_pdbx_branch_scheme.auth_mon_id
_pdbx_branch_scheme.auth_seq_num
_pdbx_branch_scheme.hetero
A 1 GLC 1 . GLC 1 ? GLC 2 n
A 1 GLC 2 . GLC 2 ? GLC 6 n
A 1 GLC 3 . GLC 3 ? GLC 7 n
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
GLC "CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL" GMML 1.0 DGlcpa
GLC "COMMON NAME" GMML 1.0 a-D-glucopyranose
GLC "IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL" PDB-CARE 1.0 a-D-Glcp
GLC "SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL" GMML 1.0 Glc
#
_pdbx_entity_branch.entity_id 1
_pdbx_entity_branch.type oligosaccharide
#
_pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal 1
_pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id 1
_pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor DGlcpa1-2DGlcpa1-6DGlcpa1-ROH
_pdbx_entity_branch_descriptor.type "Glycam Condensed Sequence"
_pdbx_entity_branch_descriptor.program GMML
_pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1.0
#
loop_
_pdbx_entity_branch_link.link_id
_pdbx_entity_branch_link.entity_id
_pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1
_pdbx_entity_branch_link.comp_id_1
_pdbx_entity_branch_link.atom_id_1
_pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1
_pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2
_pdbx_entity_branch_link.comp_id_2
_pdbx_entity_branch_link.atom_id_2
_pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2
_pdbx_entity_branch_link.value_order
_pdbx_entity_branch_link.details
1 1 2 GLC C1 O1 1 GLC O6 HO6 sing ?
2 1 3 GLC C1 O1 2 GLC O2 HO2 sing ?
#
loop_
_pdbx_entity_branch_list.entity_id
_pdbx_entity_branch_list.comp_id
_pdbx_entity_branch_list.num
_pdbx_entity_branch_list.hetero
1 GLC 1 n
1 GLC 2 n
1 GLC 3 n
#
loop_
_pdbx_entity_nonpoly.entity_id
_pdbx_entity_nonpoly.name
_pdbx_entity_nonpoly.comp_id
2 ? ROH
3 "ALPHA-CYCLODEXTRIN (CYCLOHEXA-AMYLOSE)" ACX
#
_struct_conn_type.id covale
_struct_conn_type.criteria ?
_struct_conn_type.reference ?
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 . GLC A 1 . ? 19.270 29.230 12.190 1.00 0.00 ? 1 GLC ? C1 1
HETATM 2 C C2 . GLC A 1 . ? 17.950 28.750 12.850 1.00 0.00 ? 1 GLC ? C2 1
HETATM 3 C C3 . GLC A 1 . ? 18.440 27.900 14.020 1.00 0.00 ? 1 GLC ? C3 1
HETATM 4 C C4 . GLC A 1 . ? 19.200 26.760 13.530 1.00 0.00 ? 1 GLC ? C4 1
HETATM 5 C C5 . GLC A 1 . ? 20.500 27.190 12.840 1.00 0.00 ? 1 GLC ? C5 1
HETATM 6 C C6 . GLC A 1 . ? 21.360 26.090 12.270 1.00 0.00 ? 1 GLC ? C6 1
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HETATM 23 C C5 . GLC A 1 . ? 25.060 27.690 14.040 1.00 0.00 ? 2 GLC ? C5 1
HETATM 24 C C6 . GLC A 1 . ? 24.940 28.870 15.020 1.00 0.00 ? 2 GLC ? C6 1
HETATM 25 O O2 . GLC A 1 . ? 25.010 25.220 10.630 1.00 0.00 ? 2 GLC ? O2 1
HETATM 26 O O3 . GLC A 1 . ? 27.260 27.090 11.110 1.00 0.00 ? 2 GLC ? O3 1
HETATM 27 O O4 . GLC A 1 . ? 27.400 28.260 13.760 1.00 0.00 ? 2 GLC ? O4 1
HETATM 28 O O5 . GLC A 1 . ? 23.770 27.680 13.260 1.00 0.00 ? 2 GLC ? O5 1
HETATM 29 O O6 . GLC A 1 . ? 24.670 30.100 14.230 1.00 0.00 ? 2 GLC ? O6 1
HETATM 30 H H1 . GLC A 1 . ? 23.770 25.580 12.940 1.00 0.00 ? 2 GLC ? H1 1
HETATM 31 H H2 . GLC A 1 . ? 24.700 27.280 10.760 1.00 0.00 ? 2 GLC ? H2 1
HETATM 32 H H3 . GLC A 1 . ? 26.570 25.840 12.700 1.00 0.00 ? 2 GLC ? H3 1
HETATM 33 H H4 . GLC A 1 . ? 25.860 28.870 12.520 1.00 0.00 ? 2 GLC ? H4 1
HETATM 34 H H5 . GLC A 1 . ? 25.170 26.680 14.440 1.00 0.00 ? 2 GLC ? H5 1
HETATM 35 H H61 . GLC A 1 . ? 24.200 28.700 15.800 1.00 0.00 ? 2 GLC ? H61 1
HETATM 36 H H62 . GLC A 1 . ? 25.870 29.020 15.580 1.00 0.00 ? 2 GLC ? H62 1
HETATM 37 C C1 . GLC A 1 . ? 25.080 25.450 9.230 1.00 0.00 ? 3 GLC ? C1 1
HETATM 38 C C2 . GLC A 1 . ? 25.580 24.230 8.480 1.00 0.00 ? 3 GLC ? C2 1
HETATM 39 C C3 . GLC A 1 . ? 25.560 24.400 6.920 1.00 0.00 ? 3 GLC ? C3 1
HETATM 40 C C4 . GLC A 1 . ? 24.200 24.920 6.420 1.00 0.00 ? 3 GLC ? C4 1
HETATM 41 C C5 . GLC A 1 . ? 23.760 26.180 7.200 1.00 0.00 ? 3 GLC ? C5 1
HETATM 42 C C6 . GLC A 1 . ? 22.450 26.850 6.920 1.00 0.00 ? 3 GLC ? C6 1
HETATM 43 O O2 . GLC A 1 . ? 26.990 23.940 8.870 1.00 0.00 ? 3 GLC ? O2 1
HETATM 44 O O3 . GLC A 1 . ? 25.830 23.120 6.260 1.00 0.00 ? 3 GLC ? O3 1
HETATM 45 O O4 . GLC A 1 . ? 24.210 25.190 4.940 1.00 0.00 ? 3 GLC ? O4 1
HETATM 46 O O5 . GLC A 1 . ? 23.760 25.890 8.710 1.00 0.00 ? 3 GLC ? O5 1
HETATM 47 O O6 . GLC A 1 . ? 21.240 25.980 7.390 1.00 0.00 ? 3 GLC ? O6 1
HETATM 48 H H1 . GLC A 1 . ? 25.750 26.290 9.050 1.00 0.00 ? 3 GLC ? H1 1
HETATM 49 H H2 . GLC A 1 . ? 24.930 23.430 8.830 1.00 0.00 ? 3 GLC ? H2 1
HETATM 50 H H3 . GLC A 1 . ? 26.330 25.130 6.680 1.00 0.00 ? 3 GLC ? H3 1
HETATM 51 H H4 . GLC A 1 . ? 23.480 24.120 6.580 1.00 0.00 ? 3 GLC ? H4 1
HETATM 52 H H5 . GLC A 1 . ? 24.450 27.010 7.060 1.00 0.00 ? 3 GLC ? H5 1
HETATM 53 H H61 . GLC A 1 . ? 22.380 27.840 7.380 1.00 0.00 ? 3 GLC ? H61 1
HETATM 54 H H62 . GLC A 1 . ? 22.350 27.040 5.850 1.00 0.00 ? 3 GLC ? H62 1
HETATM 55 H HO1 . ROH B 2 . ? 19.560 30.840 11.260 1.00 0.00 ? 1 ROH ? HO1 1
HETATM 56 O O1 . ROH B 2 . ? 19.020 30.070 11.070 1.00 0.00 ? 1 ROH ? O1 1
HETATM 57 O O1A . ACX C 3 . ? 16.010 30.890 11.690 1.00 0.00 ? 3 ACX ? O1A 1
HETATM 58 C C1A . ACX C 3 . ? 16.090 30.170 12.690 1.00 0.00 ? 3 ACX ? C1A 1
HETATM 59 C C2A . ACX C 3 . ? 14.900 29.250 13.100 1.00 0.00 ? 3 ACX ? C2A 1
HETATM 60 H H1A . ACX C 3 . ? 15.170 28.210 13.280 1.00 0.00 ? 3 ACX ? H1A 1
HETATM 61 H H2A . ACX C 3 . ? 14.170 29.400 12.310 1.00 0.00 ? 3 ACX ? H2A 1
HETATM 62 H H3A . ACX C 3 . ? 14.440 29.670 13.990 1.00 0.00 ? 3 ACX ? H3A 1
HETATM 63 O O1A . ACX D 3 . ? 17.650 29.090 16.520 1.00 0.00 ? 4 ACX ? O1A 1
HETATM 64 C C1A . ACX D 3 . ? 17.040 28.110 15.990 1.00 0.00 ? 4 ACX ? C1A 1
HETATM 65 C C2A . ACX D 3 . ? 15.840 27.460 16.720 1.00 0.00 ? 4 ACX ? C2A 1
HETATM 66 H H1A . ACX D 3 . ? 16.090 26.450 17.040 1.00 0.00 ? 4 ACX ? H1A 1
HETATM 67 H H2A . ACX D 3 . ? 15.020 27.440 16.000 1.00 0.00 ? 4 ACX ? H2A 1
HETATM 68 H H3A . ACX D 3 . ? 15.510 28.130 17.510 1.00 0.00 ? 4 ACX ? H3A 1
HETATM 69 O O1A . ACX E 3 . ? 17.960 24.710 15.650 1.00 0.00 ? 5 ACX ? O1A 1
HETATM 70 C C1A . ACX E 3 . ? 18.950 24.750 14.940 1.00 0.00 ? 5 ACX ? C1A 1
HETATM 71 C C2A . ACX E 3 . ? 19.600 23.460 14.320 1.00 0.00 ? 5 ACX ? C2A 1
HETATM 72 H H1A . ACX E 3 . ? 19.520 23.370 13.230 1.00 0.00 ? 5 ACX ? H1A 1
HETATM 73 H H2A . ACX E 3 . ? 19.250 22.550 14.800 1.00 0.00 ? 5 ACX ? H2A 1
HETATM 74 H H3A . ACX E 3 . ? 20.670 23.570 14.470 1.00 0.00 ? 5 ACX ? H3A 1
HETATM 75 O O1A . ACX F 3 . ? 26.740 21.620 9.240 1.00 0.00 ? 8 ACX ? O1A 1
HETATM 76 C C1A . ACX F 3 . ? 27.400 22.710 9.320 1.00 0.00 ? 8 ACX ? C1A 1
HETATM 77 C C2A . ACX F 3 . ? 28.720 22.830 10.120 1.00 0.00 ? 8 ACX ? C2A 1
HETATM 78 H H1A . ACX F 3 . ? 28.570 23.340 11.080 1.00 0.00 ? 8 ACX ? H1A 1
HETATM 79 H H2A . ACX F 3 . ? 29.470 23.470 9.660 1.00 0.00 ? 8 ACX ? H2A 1
HETATM 80 H H3A . ACX F 3 . ? 29.170 21.850 10.260 1.00 0.00 ? 8 ACX ? H3A 1
HETATM 81 O O1A . ACX G 3 . ? 28.080 23.400 6.240 1.00 0.00 ? 9 ACX ? O1A 1
HETATM 82 C C1A . ACX G 3 . ? 27.050 22.780 5.940 1.00 0.00 ? 9 ACX ? C1A 1
HETATM 83 C C2A . ACX G 3 . ? 27.120 21.490 5.150 1.00 0.00 ? 9 ACX ? C2A 1
HETATM 84 H H1A . ACX G 3 . ? 27.110 20.630 5.820 1.00 0.00 ? 9 ACX ? H1A 1
HETATM 85 H H2A . ACX G 3 . ? 28.020 21.440 4.530 1.00 0.00 ? 9 ACX ? H2A 1
HETATM 86 H H3A . ACX G 3 . ? 26.270 21.440 4.480 1.00 0.00 ? 9 ACX ? H3A 1
HETATM 87 O O1A . ACX H 3 . ? 22.540 24.200 3.880 1.00 0.00 ? 10 ACX ? O1A 1
HETATM 88 C C1A . ACX H 3 . ? 23.720 24.330 4.110 1.00 0.00 ? 10 ACX ? C1A 1
HETATM 89 C C2A . ACX H 3 . ? 24.750 23.540 3.300 1.00 0.00 ? 10 ACX ? C2A 1
HETATM 90 H H1A . ACX H 3 . ? 24.810 23.890 2.270 1.00 0.00 ? 10 ACX ? H1A 1
HETATM 91 H H2A . ACX H 3 . ? 24.510 22.480 3.320 1.00 0.00 ? 10 ACX ? H2A 1
HETATM 92 H H3A . ACX H 3 . ? 25.750 23.740 3.680 1.00 0.00 ? 10 ACX ? H3A 1
HETATM 93 O O1A . ACX I 3 . ? 20.130 27.810 8.030 1.00 0.00 ? 11 ACX ? O1A 1
HETATM 94 C C1A . ACX I 3 . ? 20.290 26.610 8.080 1.00 0.00 ? 11 ACX ? C1A 1
HETATM 95 C C2A . ACX I 3 . ? 19.310 25.630 8.760 1.00 0.00 ? 11 ACX ? C2A 1
HETATM 96 H H1A . ACX I 3 . ? 18.360 26.150 8.770 1.00 0.00 ? 11 ACX ? H1A 1
HETATM 97 H H2A . ACX I 3 . ? 19.600 25.410 9.780 1.00 0.00 ? 11 ACX ? H2A 1
HETATM 98 H H3A . ACX I 3 . ? 19.370 24.730 8.140 1.00 0.00 ? 11 ACX ? H3A 1
HETATM 99 O O1A . ACX J 3 . ? 28.830 25.600 11.810 1.00 0.00 ? 12 ACX ? O1A 1
HETATM 100 C C1A . ACX J 3 . ? 28.390 26.380 10.950 1.00 0.00 ? 12 ACX ? C1A 1
HETATM 101 C C2A . ACX J 3 . ? 28.920 26.490 9.550 1.00 0.00 ? 12 ACX ? C2A 1
HETATM 102 H H1A . ACX J 3 . ? 28.950 25.470 9.170 1.00 0.00 ? 12 ACX ? H1A 1
HETATM 103 H H2A . ACX J 3 . ? 29.920 26.910 9.600 1.00 0.00 ? 12 ACX ? H2A 1
HETATM 104 H H3A . ACX J 3 . ? 28.290 27.130 8.940 1.00 0.00 ? 12 ACX ? H3A 1
HETATM 105 O O1A . ACX K 3 . ? 27.720 30.350 14.460 1.00 0.00 ? 13 ACX ? O1A 1
HETATM 106 C C1A . ACX K 3 . ? 27.940 29.420 13.700 1.00 0.00 ? 13 ACX ? C1A 1
HETATM 107 C C2A . ACX K 3 . ? 28.980 29.510 12.540 1.00 0.00 ? 13 ACX ? C2A 1
HETATM 108 H H1A . ACX K 3 . ? 29.580 30.410 12.410 1.00 0.00 ? 13 ACX ? H1A 1
HETATM 109 H H2A . ACX K 3 . ? 28.540 29.280 11.560 1.00 0.00 ? 13 ACX ? H2A 1
HETATM 110 H H3A . ACX K 3 . ? 29.670 28.680 12.670 1.00 0.00 ? 13 ACX ? H3A 1
HETATM 111 O O1A . ACX L 3 . ? 22.960 31.020 15.390 1.00 0.00 ? 14 ACX ? O1A 1
HETATM 112 C C1A . ACX L 3 . ? 23.490 30.740 14.300 1.00 0.00 ? 14 ACX ? C1A 1
HETATM 113 C C2A . ACX L 3 . ? 22.890 31.110 12.950 1.00 0.00 ? 14 ACX ? C2A 1
HETATM 114 H H1A . ACX L 3 . ? 22.960 32.200 12.870 1.00 0.00 ? 14 ACX ? H1A 1
HETATM 115 H H2A . ACX L 3 . ? 21.860 30.750 12.970 1.00 0.00 ? 14 ACX ? H2A 1
HETATM 116 H H3A . ACX L 3 . ? 23.530 30.650 12.200 1.00 0.00 ? 14 ACX ? H3A 1
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